Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkceP16054 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkceP16054 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms