Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme1P15532 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms