Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmnb1P14733 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb1P14733 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms