Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd1d1P11609 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd1d1P11609 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms