Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lamp1P11438 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp1P11438 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms