Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spp1P10923 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spp1P10923 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms