Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh3P10287 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh3P10287 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms