Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Myod1P10085 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms