Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms