Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Amd1P0DMN7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms