Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc9P09633 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc9P09633 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms