Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc8P09025 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc8P09025 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms