Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sod1P08228 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sod1P08228 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms