Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a2P08122 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a2P08122 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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