Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr1P08046 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Egr1P08046 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms