Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spta1P08032 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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