Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06344 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06344 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06344 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06344 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06344 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06344 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06344 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06344 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06344 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06344 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06344 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06344 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06344 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06344 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms