Protein–RNA interactions for Protein: P04247

Mb, Myoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MbP04247 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MbP04247 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MbP04247 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MbP04247 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MbP04247 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MbP04247 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms