Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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