Protein–RNA interactions for Protein: P02716

Chrnd, Acetylcholine receptor subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrndP02716 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChrndP02716 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms