Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01852 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01852 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01852 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01852 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01852 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01852 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01852 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01852 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01852 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01852 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01852 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01852 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms