Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01748 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01748 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01748 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01748 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01748 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01748 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01748 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01748 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01748 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01748 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01748 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01748 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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