Protein–RNA interactions for Protein: P01675

Ig kappa chain V-VI region XRPC 44, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01675 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01675 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01675 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01675 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01675 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01675 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01675 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01675 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01675 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01675 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01675 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01675 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01675 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01675 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01675 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms