Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01673 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01673 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01673 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01673 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01673 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01673 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01673 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
P01673 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01673 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01673 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01673 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01673 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01673 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01673 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01673 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01673 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01673 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01673 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms