Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01669 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01669 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01669 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01669 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01669 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01669 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01669 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01669 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01669 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01669 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01669 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01669 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01669 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01669 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms