Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01641 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01641 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01641 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01641 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01641 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01641 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01641 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01641 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01641 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01641 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01641 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01641 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01641 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01641 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01641 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01641 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01641 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P01641 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01641 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01641 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01641 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01641 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01641 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01641 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01641 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01641 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01641 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01641 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01641 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01641 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms