Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo1O89026 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo1O89026 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Robo1O89026 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Robo1O89026 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Robo1O89026 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Robo1O89026 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Robo1O89026 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Robo1O89026 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Robo1O89026 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms