Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcn2O88968 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms