Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnpda1O88958 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gnpda1O88958 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms