Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms