Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BlmO88700 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BlmO88700 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BlmO88700 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BlmO88700 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BlmO88700 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BlmO88700 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BlmO88700 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BlmO88700 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BlmO88700 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BlmO88700 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BlmO88700 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BlmO88700 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BlmO88700 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BlmO88700 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BlmO88700 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BlmO88700 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BlmO88700 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BlmO88700 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BlmO88700 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BlmO88700 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BlmO88700 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BlmO88700 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BlmO88700 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BlmO88700 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BlmO88700 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BlmO88700 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
BlmO88700 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BlmO88700 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BlmO88700 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BlmO88700 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BlmO88700 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BlmO88700 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BlmO88700 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BlmO88700 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BlmO88700 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BlmO88700 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BlmO88700 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BlmO88700 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BlmO88700 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BlmO88700 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BlmO88700 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BlmO88700 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BlmO88700 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BlmO88700 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BlmO88700 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BlmO88700 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BlmO88700 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BlmO88700 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BlmO88700 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BlmO88700 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BlmO88700 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BlmO88700 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BlmO88700 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BlmO88700 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BlmO88700 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BlmO88700 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BlmO88700 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BlmO88700 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BlmO88700 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BlmO88700 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BlmO88700 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BlmO88700 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BlmO88700 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BlmO88700 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BlmO88700 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BlmO88700 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BlmO88700 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BlmO88700 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BlmO88700 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BlmO88700 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BlmO88700 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BlmO88700 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BlmO88700 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BlmO88700 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms