Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmx1bO88609 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms