Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacng2O88602 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacng2O88602 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms