Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ComtO88587 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ComtO88587 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ComtO88587 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ComtO88587 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ComtO88587 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ComtO88587 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ComtO88587 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ComtO88587 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ComtO88587 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ComtO88587 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ComtO88587 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ComtO88587 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ComtO88587 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ComtO88587 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ComtO88587 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ComtO88587 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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ComtO88587 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ComtO88587 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ComtO88587 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ComtO88587 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ComtO88587 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ComtO88587 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ComtO88587 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ComtO88587 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ComtO88587 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ComtO88587 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ComtO88587 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ComtO88587 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ComtO88587 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms