Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops4O88544 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops4O88544 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms