Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme6O88425 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms