Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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