Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nid2O88322 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nid2O88322 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nid2O88322 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms