Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp4O70480 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms