Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtssO70370 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtssO70370 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtssO70370 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtssO70370 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtssO70370 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms