Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxq1O70220 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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