Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd70O55237 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd70O55237 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd70O55237 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms