Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad51dO55230 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms