Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChkbO55229 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChkbO55229 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms