Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms