Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms