Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc3O55013 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms