Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp10aO54827 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms