Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5r2O35926 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms