Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp100O35892 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sp100O35892 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sp100O35892 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sp100O35892 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sp100O35892 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sp100O35892 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sp100O35892 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sp100O35892 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sp100O35892 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp100O35892 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sp100O35892 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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